La presencia de agua en el sistema de combustible es una de las causas más comunes y, al mismo tiempo, más difíciles de diagnosticar de los daños en los motores en el ámbito marítimo. Ya sea por condensación en los sistemas de ventilación de los tanques, tapones de llenado con fugas, suministros de combustible con un alto contenido de agua o las propiedades higroscópicas de los componentes de los biocombustibles modernos: el agua llega al tanque de combustible por diversas vías y, desde allí, a todo el sistema de inyección.